Shiki Granbell è cresciuto fin dall'infanzia da una comunità di robot nel Regno di Granbell, un parco a tema abbandonato. Il luogo viene visitato da due B-Cuber - Rebecca Bluegarden e il suo gatto robotico, Happy - con cui Shiki cerca di fare amicizia ma con scarso successo. Il giorno successivo, i robot del parco diventano ostili verso Shiki e Rebecca, dichiarando vendetta contro gli umani per averli scartati. Shiki reagisce e salva la ragazza con la sua abilità gravitazionale Ether Gear, guadagnandosi la sua amicizia. Rebecca e Happy portano Shiki fuori dal pianeta sulla loro astronave, l'Aqua Wing, prima che i robot si rompano contemporaneamente a causa della vecchiaia dei loro sistemi, rivelando così di aver organizzato la loro ribellione per salvare Shiki dalla solitudine. I tre arrivano al pianeta Blue Garden e registrano Shiki nella gilda di avventurieri Shooting Starlight, dove Shiki riconosce un ologramma di una dea cosmica chiamata Mother. Quando la gilda non crede al suo presunto incontro con Mother, i tre decidono di trovarla e provare la sua esistenza, viaggiando sul pianeta Norma per acquisire una nave migliore dal professor Weitz Steiner, benefattore di Rebecca e Happy. Dopo aver visitato il laboratorio di Weitz, i tre si ritrovano dinanzi a un minaccioso sconosciuto che si presenta con il nome del professore.