Spider-Man si trasforma in un eroe dei manga: l'ultimo Spider-Ninja! Dopo l'omicidio dello zio Ben, Peter Parker sceglie di combattere il crimine nascondendo la propria identità. In equilibrio tra la sua vita da adolescente e quella da ninja, lotta anche per mantenere il suo segreto con la fragile zia May. Davanti alla tomba del suo sensei, Peter si imbarca in una ricerca per scoprire le origini dello Spider-Clan, solo per pentirsi di ciò che apprende…