Dopo il misogi, il rapporto tra Yato e Yukine è migliorato; il ragazzo lavora part-time per risarcire i furti commessi e intanto prende lezioni da Hiyori sugli argomenti delle medie. Yato, però, è preoccupato dal fatto che Hiyori si stia avvicinando troppo al loro mondo e, anche grazie ai consigli di Tenjin, decide di evitare la ragazza. Nel frattempo, Kazuma cerca di far reagire Bishamon, che, pur di non creare squilibri tra i suoi strumenti, nasconde le sue sofferenze. La dea viene curata dallo strumento Kugaha, che tuttavia si dimostra essere in combutta con Nora. Mentre quest'ultima avvicina Yato, il medico cerca di indebolire ulteriormente la dea usando gli strumenti stessi, ossia uccidendo Suzuha e nascondendo la corruzione di Aiha. Kugaha, infatti, vorrebbe far rinascere la dea così da prendere il posto di Kazuma come sua guida; Kazuma, intanto, inizia a sospettare delle pessime condizioni di Bishamon, ma non riesce a risolvere la situazione. Yato ha un confronto con Kugaha, dal quale capisce che dietro allo strumento c'è il "Padre", la figura che manovra anche Nora.