Una misteriosa donna incinta precipita dal cielo, su una Tokyo del futuro. Quando partorisce, dà alla luce un bambino capace di volare. Il neonato viene chiamato Icaro. L' infante viene in segreto in un grande laboratorio ... Venti anni dopo, Icaro è ancora rinchiuso lì dentro, non è mai uscito all'aria aperta, ed è continuamente studiato. Ma un giorno si innamora della sua insegnate Yukiko, l'unica a trattalo con affetto, e comincia così ad aver voglia di evadere da quel posto con lei…